2017 ÚSTAV IMUNOLOGIE A MIKROBIOLOGIE VÝROČNÍ ZPRÁVA

ÚSTAV IMUNOLOGIE A MIKROBIOLOGIE

2017

OBSAH

1. ZÁKLADNÍ INFORMACE ... - 3 -

2. ZÁKLADNÍ EKONOMICKÁ CHARAKTERISTIKA ... - 1 -

3. VÝZNAMNÉ UDÁLOSTI ... - 4 -

3.1. VÝZNAMNÁ OCENĚNÍ PRACOVNÍKŮ ÚIM ... - 4 -

4. PEDAGOGICKÁ ČINNOST ... - 4 -

4.1. BAKALÁŘSKÉ STUDIUM ... - 4 -

4.2. MAGISTERSKÉ STUDIUM ... - 5 -

4.2.1. IMUNOLOGIE ... - 5 -

4.2.2. MIKROBIOLOGIE ... - 6 -

4.2.3. NAVAZUJÍCÍ MAGISTERSKÉ STUDIUM……….……….- 7 -

4.3. ROZDĚLENÍ VÝUKOVÉ ČINNOSTI ... - 7 -

4.4. SYLABY ... - 9 -

4.5. VÝUKA NA JINÝCH ÚSTAVECH A KLINIKÁCH 1.LF UK, JINÝCH FAKULTÁCH UK A OSTATNÍCH UNIVERZITÁCH A VŠ V ČR…...-16 -

4.5.1. VÝUKA NA JINÝCH ÚSTAVECH A KLINIKÁCH 1. LF UK ... - 16 -

4.5.2. VÝUKA NA JINÝCH FAKULTÁCH UK ... - 17 -

4.5.3. VÝUKA NA OSTATNÍCH UNIVERZITÁCH A VŠ V ČR………- 17 -

4.6. SPECIALIZAČNÍ A CELOŽIVOTNÍ VZDĚLÁVÁNÍ ... - 17 -

4.7. PREGRADUÁLNÍ STUDIUM – DIPLOMANTI, BAKALÁŘI ... - 18 -

4.7.1. OBHÁJENÉ BAKALÁŘSKÉ PRÁCE………...……- 19 -

4.7.2. OBHÁJENÉ DIPLOMOVÉ PRÁCE……….………- 19 -

4.8. POSTGRADUÁLNÍ STUDIUM ... - 19 -

4.8.1. ŠKOLITELÉ V POSTGRADUÁLNÍM STUDIU ... - 20 -

4.8.2. OBHÁJENÉ DIZERTAČNÍ PRÁCE ... - 21 -

4.8.3. PŘEDATESTAČNÍ PŘÍPRAVA ... - 21 -

4.8.4. ZKUŠEBNÍ A HODNOTÍCÍ KOMISE……….………- 21 -

4.9. SEMINÁŘE ÚIM ... - 21 -

5. VĚDECKO-VÝZKUMNÁ ČINNOST ... - 22 -

5.1. GRANTY ... - 23 -

5.1.1. GRANTOVÉ PROJEKTY ... - 23 -

5.1.2. VÝZKUMNÉ ZÁMĚRY – SPOLUPRÁCE ... - 24 -

6. PUBLIKAČNÍ ČINNOST ... - 24 -

6.1. PŘEHLED PUBLIKAČNÍ ČINNOSTI V LETECH 2005 – 2017 ... - 24 -

6.2. PŮVODNÍ ODBORNÉ PRÁCE ... - 25 -

6.3. PŘEHLEDOVÉ ČLÁNKY ... - 27 -

6.4. KAPITOLY V MONOGRAFII ... - 28 -

6.5. ABSTRAKTA PŘEDNÁŠEK A POSTERŮ ... - 28 -

6.6. PŘEDNÁŠKY V ZAHRANIČÍ (MEZINÁRODNÍ KONFERENCE POŘÁDANÉ V ČR) ... - 30 -

6.7. POSTERY V ZAHRANIČÍ ... - 31 -

6.8. PŘEDNÁŠKY A POSTERY V ČR ... - 32 -

6.9. VÝUKOVÉ TEXTY ... - 33 -

6.10. POPULARIZUJÍCÍ ČINNOST ... - 33 -

7. OPONENTSKÉ POSUDKY, PROTOKOLY A RECENZE ... - 34 -

8. SPOLUPRÁCE MEZI KLINIKAMI A ÚSTAVY ... - 35 -

8.1. 1. LF UK ... - 35 -

8.2. SPOLUPRÁCE S JINÝMI PRACOVIŠTI V ČR ... - 35 -

8.3. ZAHRANIČNÍ STYKY ... - 37 -

9. JINÁ ODBORNÁ ČINNOST ... - 37 -

9.1. ORGANIZACE KONGRESŮ, SYMPOSIÍ ... - 37 -

9.2. STUDIJNÍ POBYTY, SJEZDY A KURZY V ZAHRANIČÍ ... - 38 -

9.3. KURZY, SJEZDY, SEMINÁŘE V ČR ... - 38 -

9.4. FUNKCE VE VĚDECKÝCH A PROFESNÍCH SPOLEČNOSTECH, KOMISÍCH A RADÁCH ... - 39 -

9.5. ČLENSTVÍ V REDAKČNÍCH RADÁCH ... - 41 -

9.6. ČLENSTVÍ V OBOROVÝCH A VĚDECKÝCH SPOLEČNOSTECH ... - 41 -

10. KONTAKTY ... - 42 -

10.1. ADRESA ... - 42 -

10.2. JMENOVITÝ SEZNAM PRACOVNÍKŮ ... - 43 -

1. ZÁKLADNÍ INFORMACE

ÚIM mělo 88 zaměstnanců, z toho 75 VŠ. Sídlo ústavu je na Albertově - Studničkova 7, Praha 2, 128 00 a na Karlově náměstí – Fakultní poliklinika, budova A, IV. patro, Karlovo náměstí 32, Praha 2.

Přednostkou ústavu je prof. RNDr. Libuše Kolářová, CSc., primářem klinické části je MUDr. Josef Krupička.

Organizační schéma ÚIM

2. ZÁKLADNÍ EKONOMICKÁ CHARAKTERISTIKA

Počet provedených klinických vyšetření 44 670 Počet léčených pacientů 20 222 Počet pacientů léčených alergenovou imunoterapií 245 Počet sérologických vyšetření – diagnostika na NRL 6 961

NRL - počet vykázaných bodů 3 054 361

Počet zaměstnanců VFN 25

1. LF 74

3. VÝZNAMNÉ UDÁLOSTI

3.1. Významná ocenění pracovníků ÚIM

HRDÝ J. – cena Společnosti pro probiotika a prebiotika za nejlepší publikaci 11.4. 2017

HNILICOVÁ Š., HRDÝ J. – Vliv intranasální imunizace delipidovaným Bacillus firmus na imunitní odpověď v NALT. 18. Studentská vědecká konference 1. LF UK, 23.5. 2017, cena za 2. místo v posterové sekci pregraduálních prací

PROKEŠOVÁ L. – děkanem fakulty udělen Pamětní list k příležitosti 75. narozenin

4. PEDAGOGICKÁ ČINNOST

Pedagogická činnost Ústavu imunologie a mikrobiologie je založena na výuce dvou samostatných oborů:

Imunologie a Mikrobiologie. V rámci těchto oborů jsou v pregraduálním studiu vyučovány v českém a anglickém jazyce jednotlivé předměty v rámci magisterského studia všeobecného a zubního lékařství, ale i bakalářského studia různých oborů. Pracovnící ústavu se podílejí na postgraduální výuce doktorandů zapsaných zejména do biomedicínských doktorských studijních programů, postgraduální předatestační přípravě lékařů a jiných odborných pracovníků ve zdravotnictví, celoživotním vzdělávání a výuce pro Univerzitu 3. věku. Někteří pracovníci rovněž vedou bakalářské a diplomové práce studentů jiných VŠ (zejména PřFUK).

4.1. Bakalářské studium

Pracoviště zajišťuje v roce 2016/2017 výuku předmětu Mikrobiologie a imunologie pro obory: Všeobecná sestra, Nutriční terapeut a Porodní asistentka (prezenční a kombinovaná forma studia – VS, NT, PA).

Prezenční forma studia je vyučována společně pro oba obory v rámci společného kmene.

Celkem bylo v roce 2016/2017 odučeno 180 hodin přednášek, 150 hodin konzultací a soustředění pro 95 studentů a vyzkoušeno bylo 81 studentů.

Zkoušející předmětu Mikrobiologie a imunologie oborů VS, NT a PA v roce 2016/2017

4.2. Magisterské studium 4.2.1. Imunologie

ÚIM zajišťuje výuku předmětů Základy imunologie a Imunologie v zubním lékařství (ve spolupráci se Stomatologickou klinikou) pro obor Zubního lékařství – 2. ročník, dále Základy imunologie pro obor Všeobecného lékařství (2. ročník), Klinická imunologie formou týdenního bloku přednášek a seminářů ve 4. ročníku oboru Všeobecné lékařství. Další součástí výuky imunologie je nabídka volitelných předmětů (Ekoimunologie, Základy práce v imunologické laboratoři, Laboratorní metody v imunologii, Alergologie v praxi, Imunologie v klinické praxi I – medicína v souvislostech, Novinky v imunologii a Updates in immunology, od 2017 nový volitelný předmět Imunologie pohledem klinického lékaře - medicína v souvislostech II). Celkem bylo v akademickém roce 2016/2017 odučeno 756 hodin v rámci 15 imunologických předmětů (celkem zapsáno 1010 studentů). V roce 2016/2017 bylo vyzkoušeno 472 studentů. Pro studenty 2. ročníku Všeobecného lékařství byly připraveny zápočtové testy (cca 530 testů).

Zkoušející imunologických předmětů v roce 2016/2017

4.2.2. Mikrobiologie

ÚIM zajišťuje výuku předmětů Mikrobiologie 1 a Mikrobiologie 2 (přednášky, praktická cvičení) a Integrovaného bloku mikrobiologie a patologie posluchačů Všeobecného lékařství a Mikrobiologie (přednášky, praktická cvičení) posluchačů zubního lékařství v české a anglické paralelce.

V rámci mikrobiologie bylo odpřednášeno na přednáškách a seminářích 455 hodin včetně povinně volitelných předmětů a výuka praktických cvičení činila 526 hodin. Počet zapsaných studentů na veškeré předměty mikrobiologie činil celkem 1255. Celkem bylo vyzkoušeno v rámci předmětů Mikrobiologie 483 studentů a uděleno 951 zápočtů.

Zkoušející předmětu Mikrobiologie 2 a Mikrobiologie (Všeobecné i Zubní lékařství) v ČJ v roce 2016/2017

Zkoušející předmětu Mikrobiologie 2 a Mikrobiologie (Všeobecné i Zubní lékařství) v AJ v roce 2016/2017

Volitelné předměty vyučované v rámci mikrobiologie jsou: Moderní diagnostické techniky v mikrobiologii a imunologii, Tropické nemoci 1,2 (oba pro českou i anglickou paralelku), Klinická mikrobiologie – diagnostika a interpretace laboratorních nálezů, Klinická mikrobiologie v oblasti primární péče, Klinická mikrobiologie u hospitalizovaných pacientů a Lékařská parazitologie.

4.2.3. Navazující magisterské studium

ÚIM zajišťuje pro výuku nutričních specialistů předmět Speciální mikrobiologie a imunologie pro nutricionisty, potravinové alergie. Výuka byla rozdělena do 38 hodin pro prezenční a kombinované studium, do kterého bylo zapsáno 46 studentů (tříčlennou zkušební komisí vyzkoušeno 44 studentů).

Celkový počet zkoušení za celý ÚIM činí 1080.

Stejně jako v předchozích letech trvá pronájem jedné učebny praktických cvičení mikrobiologie FBMI ČVUT pro obor zdravotní laborant.

4.3. Rozdělení výukové činnosti

Ústav imunologie a mikrobiologie zajišťuje českou i anglickou výuku povinných i volitelných předmětů imunologie a mikrobiologie posluchačů magisterského studia oborů Všeobecné lékařství, Zubní lékařství a posluchačů bakalářského studia - Nutriční terapeut, Všeobecná sestra (presenční i kombinovaná forma studia) a navazujícího magisterského studia Nutriční specialista.

.

Přehled vyučovaných předmětů na ÚIM Kód

Název předmětu Ročník Semestr

Magisterské studium

Všeobecné lékařství – povinné předměty

B02078 Základy imunologie 2 LS

B82078 Basic Immunology 2 LS

B00033 Klinická imunologie 4 ZS, LS

B80033 Medical Immunology 4 ZS

B80035 Microbiology 1 2 LS

B00035 Mikrobiologie 1 2 LS

B00382 Mikrobiologie 2 3 ZS

B80382 Microbiology 2 3 ZS

B00054 Integrovaný blok mikrobiologie a patologie

3 ZS

B80054 Integrated Block Mikrobiology/Pathology 3 ZS Zubní lékařství – povinné předměty

B01144 Imunologie v zubním lékařství 2 LS

B81144 Immunology in Dentistry 2 LS

B01153 Základy imunologie Z 2 LS

B81153 Basic Immunology Z 2 LS

B01148 Mikrobiologie 2 LS

B81148 Microbiology 2 LS

Nutriční specialista – povinné předměty

B02721 Speciální mikrobiologie a imunologie pro nutricionisty, potravinové alergie

1 prezenč ní

ZS

B02762 Speciální mikrobiologie a imunologie pro nutricionisty, potravinové alergie

1 kombino vaná

ZS

Bakalářské studium Nutriční terapeut

B01718 Mikrobiologie a imunologie – prezenční forma

2 ZS

B02283 Mikrobiologie a imunologie –

kombinovaná forma 2 ZS, LS

Všeobecná sestra

B01841 Mikrobiologie a imunologie – kombinovaná forma

2 LS

B01754 Mikrobiologie a imunologie – prezenční forma

2 LS

Všeobecné lékařství, Zubní lékařství, Stomatologie, Bakalářské studium – volitelné předměty

Kód Název předmětu Ročník Studijní obory

B02692 Alergologie v praxi 4,5,6 LEK

B02708 Imunologie v klinické praxi I – medicína v souvislostech

4,5,6 LEK B02959 Imunologie pohledem klinického lékaře -

medicína v souvislostech II 4,5,6 LEK

B00134 Tropické nemoci 1,2 4,5,6 LEK,ZUB

B80134 Tropical Diseases 1,2 (4),5,6 LEK,ZUB

B01666 Ekoimunologie 3,4,5,6 LEK,ZUB,STOM,

BS B02182 Laboratorní metody v imunologii 4,5,6 LEK B01670 Moderní diagnostické techniky v

mikrobiologii a imunologii

3,4,5,6 LEK,ZUB,STOM, BS

B81670 B01966

Modern Diagnostic Techniques in Medical Microbiology and Immunology Základy práce v imunologické laboratoři

3,4,5,6 4,5,6

LEK,ZUB,STOM, BS

LEK B02086 Klinická mikrobiologie – diagnostika a

interpretace laboratorních nálezů

5 LEK

B02087 Klinická mikrobiologie v oblasti primární péče

5 LEK

B02088 Klinická mikrobiologie u

hospitalizovaných pacientů 5 LEK

B02917 Novinky v imunologii 3,4,5,6 LEK, ZUB,

STOM, BS

B82946 Updates in Immunology 3,4,5,6 LEK, ZUB,

STOM, BS

B00055 Lékařská parazitologie 2,3,4 LEK, ZUB

ÚIM zajišťuje jednosemestrální výuku předmětu MB140P70 Lékařská mikrobiologie (garant Julák J.) a turnusového předmětu MB160P58 Diagnostika a terapie parazitárních nákaz (garant Nohýnková E.) pro Přírodovědeckou fakultu UK.

ÚIM zajišťuje dále kromě výše uvedených předmětů i vědeckou práci pregraduálních studentů, vedení diplomových prací studentů z PřF UK, postgraduální výuku v rámci doktorského studia (vedení PGS studentů) a předatestační přípravu v rámci oborů Alergologie a klinická imunologie a Lékařská mikrobiologie a dále v rámci kurzů Celoživotního vzdělávání. Výuka imunologie také probíhá formou samostatných přednášek v rámci výuky interních a chirurgických oborů.

Kromě výuky předmětu Alergologie v praxi a Imunologie v klinické praxi I – medicína v souvislostech, která se koná v budově Fakultní polikliniky, Karlovo nám. 32, je veškerá další výuka zajišťována v oblasti Albertova (seminární místnost ústavu, praktikárny pro mikrobiologii, zapůjčené přednáškové či seminární místnosti). Vlastní seminární místnost ÚIM má kapacitu 36 osob.

4.4. Sylaby

B02692 Alergologie v praxi (Humlová Z.)

Určen pro studenty všeobecného lékařství od 4. ročníku. PVP Vyšetřovací metody v alergologii.

Alergická rinitida, astma.

Léková alergie.

Atopická dermatitida.

Urtika.

Potravinová alergie.

Alergie a autoimunita.

B01666 Ekoimunologie (Petanová J.)

Určen pro studenty magisterského i bakalářského studia s bazálními znalostmi imunologie, VP.

Předmět zaměřený na sledování vlivů prostředí na imunitní systém, ovlivnění jeho funkcí.

Ekoimunologie.

Imunotoxikologie.

Imunitní systém.

Globální faktory prostředí, vliv emisí, dopravy.

Individuální faktory ovlivňující imunitní systém.

Psychoneuroimunologie.

Působení léků, abusus návykových látek.

B02708 Imunologie v klinické praxi I – medicína v souvislostech

B02959 Imunologie pohledem klinického lékaře - medicína v souvislostech II (Svoboda J.)

Určen pro studenty všeobecného lékařství od 4. ročníku. VP B01144 Imunologie v zubním lékařství

(Petanová J., Tlaskalová H., Bártová J., ve spolupráci se Stomatologickou klinikou 1. LF UK) Určen pro studenty oboru zubního lékařství.

Základní mechanismy imunitního systému uplatňující se v rozvoji onemocnění zubů, parodontu a ústní dutiny.

Úvodní přednáška: Obranné mechanizmy orální (vztah slizniční a systémové imunity).

Imunitní mechanismy onemocnění sliznic a jejich projevy.

Imunitní mechanismy onemocnění parodontu.

Parodontitida jako rizikový faktor systémových onemocnění.

Úloha polymorfismu genů v imunitních reakcích ve vztahu k orálnímu onemocnění.

Dentální materiály a imunitní reakce.

Lokální projevy koroze dentálních materiálů a aktivace imunitní reakce.

B81144 Immunology in Dentistry

((Petanová J., ve spolupráci se Stomatologickou klinikou 1. LF UK)

Určen pro studenty oboru zubního lékařství v anglickém jazyce.

The role of immune system during diseases of the oral cavity with respect to mucosal immunity.

Importance of the oral tolerance to keep the oral health. Reactions to dental materials used in stomatology.

Oral cavity and mucosal immunology.

Oral cavity diseases. Oral manifestations of systemic diseases.

Dental materials and pigmentations.

Galvanism and metal intolerance diagnostics.

MELISA test + case studies.

B02182 Laboratorní metody v imunologii

B01966 Základy práce v imunologické laboratoři (Posová H.)

Určen pro studenty všeobecného lékařství od 4. ročníku. VP

Předměty slouží k seznámení se základními laboratorními technikami používanými v imunologické laboratoři. Větší část praktických cvičení je věnována průtokové cytometrii.

B02078 Základy imunologie

(Prokešová L., Městecký J., Čechová D., Petanová J., Hrdý J., Nováková M., testy - vyučující ÚIM) Určen pro studenty oboru všeobecného lékařství, 2. ročník.

V přednáškách jsou studenti seznámeni se strukturou a základními mechanizmy imunitního systému, s regulacemi a kooperací jednotlivých složek obranných mechanismů za fyziologických podmínek i patologických stavů. Výuka je zaměřena na pochopení komplexních interakcí různých typů buněk, tkání a molekul imunitního systému.

Imunitní systém, jeho funkce a dělení.

Struktura imunitního systému.

Přirozená imunita.

Specifická imunita.

T lymfocyty.

B lymfocyty, protilátky.

Prezentace antigenu.

Zánětová odpověď. Protinádorová imunita. Transplantace.

Imunopatologické reakce a stavy v klinické praxi.

B82078 Basic Immunology

(Hrdý J., Nováková M., testy - vyučující ÚIM)

Určen pro studenty oboru všeobecného lékařství v anglickém jazyce, 2. ročník.

Structure of the immune system, its regulation and cooperation between separate components in physiologic and pathologic situations. Antigen presentation.

Introduction.

Structure of immune system.

Innate and specific immunity.

T and B lymphocytes. Immunoglobulins.

Antigen presentation.

Inflammation. Anti-tumor immunity. Transplantations.

Immunopathologic reactions and states in clinical practice.

B00033 Klinická imunologie

(Čechová D., Posová H., Petanová J., Adámková V.) Určen pro studenty oboru všeobecného lékařství.

Výuka v rámci týdenního bloku je sestavena z několika přednášek a dále seminářů, které jsou založeny především na rozboru kazuistik pacientů. V rámci předmětu jsou shrnuty základní poznatky o struktuře, mechanizmech a funkcích imunitního systému. Větší část je věnována imunopatologickým procesům a jejich manifestací v jednotlivých systémech organismu. Součástí výuky je i přehled používaných laboratorních vyšetření v rámci diferenciálně diagnostického procesu a možné terapeutické postupy. Volitelná návštěva ambulance.

Sylabus: Struktura, mechanizmy a funkce imunitního systému. Zánět a protiinfekční imunita, imunopatolo- gické reakce, imunodeficience, autoimunita, alergie, nádorová imunologie, regulace imunity, transplantace.

Klinická mikrobiologie ve vztahu k poruchám imunitních mechanismů. Možnosti vyšetřování a způsob diagnostické rozvahy, terapeutické postupy.

B80033 Clinical Immunology

(Čechová D., Posová H., Petanová J., Adámková V.)

Určen pro studenty oboru všeobecného lékařství v anglickém jazyce.

Lectures and seminars in one-week block oriented to the summary of basic immunological knowledge, application of immunopathological mechanisms into different organs and systems. Differential diagnosis of immunopathological states, their laboratory tests and treatment.

The structure, mechanisms and function of the immune system. Immunopathologic reactions, inflammation, basic immunologic diagnoses (immunodeficiency, autoimmune diseases, allergy), transplantations. Clinical microbiology in association to immune dysfunctions. Diagnostic process, laboratory tests, treatment.

B01153 Základy imunologie (Stříž I., Nováková M., Čechová D.)

Určen pro studenty oboru zubního lékařství.

V přednáškách jsou studenti seznámeni se strukturou a základními mechanizmy imunitního systému, s regulacemi a kooperací jednotlivých složek obranných mechanizmů za fyziologických podmínek i patologických stavů. Výuka je zaměřena na pochopení komplexních interakcí různých typů buněk, tkání a molekul imunitního systému. V přednášce a seminářích jsou také probírány základní imunologické metody a jejich princip.

Struktura imunitního systému, jeho dělení.

Prezentace antigenu.

Kooperace mezi buňkami imunitního systému.

Zánět.

Imunopatologické reakce.

Imunodeficience.

Autoimunita.

Alergie.

Nádorová imunologie.

Transplantace.

B81153 Basic Immunology (Stříž I., Hrdý J.)

Určen pro studenty oboru zubního lékařství v anglickém jazyce.

The structure of immune system, its regulation and cooperation between separate components in physiologic and pathologic situations. Antigen presentation, immunopathologic reactions, inflammation, basic immuno- logic diagnoses. Basic immunologic laboratory methods.

Structure of immune system.

Antigen presentation.

Cooperation between cells.

Inflammation.

Immunopathologic reactions.

Immunodeficiency.

Autoimmunity.

Allergy.

Oncoimmunology.

B02917 Novinky v imunologii (Hrdý J.)

Určen pro studenty magisterského i bakalářského studia s bazálními znalostmi imunologie, VP.

V rámci předmětu „ Novinky v imunologii“ se probírají témata, na která se nedostane v základních imunologických přednáškách, mapříklad méně známé či nedávno objevené buněčně subpopulace a jejich funkce ve zdraví a nemoci.

B82946 Updates in imunology (Hrdý J.)

Určen pro studenty magisterského i bakalářského studia s bazálními znalostmi imunologie studující v anglickém jazyce, VP. The subject „Updates in Immunology“ focuses on the hot topics in immunology recently described and current trends in immunology.

B00035 Mikrobiologie 1

(Adámková V., Bobek J., Čermáková R., Doubková Z., Holada K., Chanová M., Julák J., Kolářová L., Kupidlovská L., Mělková Z., Novák J., Pavlík E.)

Určen pro studenty oboru všeobecného lékařství.

Poskytuje základní informace z obecné mikrobiologie, speciální lékařské mikrobiologie, virologie a parazitologie. Seznamuje s nejdůležitějšími lidskými patogeny, s jejich vlastnostmi, se základy patogeneze příslušných onemocnění, se základy jejich diagnostiky, se základy imunizace, se základy antibiotické, anti- virové a antiparazitární terapie. Formou praktické výuky poskytuje základní dovednosti bakteriologického vyšetření, seznamuje s metodami odběru klinických materiálů a stanovením citlivosti bakterií na antibiotika.

B80035 Microbiology 1

(Adámková V., Holada K., Chanová M., Pavlík E., Bobek J., Petříčková K.) Určen pro studenty oboru všeobecného lékařství v anglickém jazyce.

Provides basic information on general and specialised human medical microbiology, virology, mycology and parasitology. Describes important human pathogens, their characteristic properties, pathogenicity mecha- nisms of the diseases they induce, and basics of the antibiotic, antifungal, antiviral and antioparasitic therapy of the diseases. In practical hands-on learning provides important skills for bacteriological investigation of selected samples. The students learn technics for clinical specimen collection, strategy of microbial identification and anti-microbial therapy.

B00382 Mikrobiologie 2

(Adámková V., Čermáková R., Chanová M., Julák J., Kupidlovská L., Novák J., Stejskal F., Zákoucká H., Pavlík E.)

Určen pro studenty oboru všeobecného lékařství.

Poskytuje základní informace ze speciální lékařské mikrobiologie, virologie, mykologie a parazitologie.

Seznamuje s nejdůležitějšími lidskými patogeny, s jejich vlastnostmi, se základy patogeneze příslušných onemocnění, se základy jejich diagnostiky, se základy imunizace, se základy antibiotické, antimykotické, antivirové a antiparazitární terapie. Formou praktické výuky poskytne základní dovednosti bakteriologického vyšetření vybraných klinických materiálů, metodou jejich odběru, identifikace izolovaných bakterií a se strategií antibiotické terapie.

B80382 Microbiology 2

(Adámková V., Pavlík E., Novák J., Bobek J., Petříčková K.) Určen pro studenty oboru všeobecného lékařství v anglickém jazyce.

Provides basic information on general and specialised human medical microbiology, virology, mycology and parasitology. Describes important human pathogens, their characteristic properties, pathogenicity mecha- nisms of the diseases they induce, and basics of the antibiotic, antifungal, antiviral and antioparasitic therapy of the diseases. In practical hands-on learning provides important skills for bacteriological investigation of selected samples. The student will learn technics for clinical specimen collection, strategy of microbial identification and anti-microbial therapy.

B00054 Integrovaný blok mikrobiologie a patologie

(Adámková V., Arientová S., Aster V., Bártová J., Bobek J., Doubková Z., Dušková J., Holada K., Holub M., Homolka J., Chanová M., Matěj R., Pavlík E., Prokešová L., Rozsypal H., Rusina Z., Skálová H., Stejskal F., Stříteský J., Zákoucká H.)

Určen pro studenty oboru všeobecného lékařství.

Patomorfologie jednotlivých infekčních chorob a jejich komplikací. Systémový přístup k infekčním nemo- cem a jejich vyvolavatelům. Pětidenní blok přednášek mikrobiologa (patogenní agens), patologa (jimi vyvo- lané morfologické změny) a klinika (příznaky onemocnění, diagnostika a terapie). Cílem tohoto bloku před- nášek není pouhé shrnutí nově nabytých znalostí z oborů mikrobiologie a patologie, ale i přispění ke změně myšlení budoucích lékařů k respektování souvislostí, příčin a důsledků v celé šíři diferenciálně diagnostických postupů. Rovněž chceme ukázat nutnost úzké spolupráce mezi specialisty různých lékařs- kých oborů pro stanovení diagnózy onemocnění pacienta a jeho léčby. Studenti zároveň získají představu o roli paraklinických oborů v diagnostice a léčbě onemocnění.

B80054 Integrated Block: Microbiology/Pathology

(Aster V.,

Bobek J.,

Určen pro studenty oboru všeobecného lékařství v anglickém jazyce.

A five day block of lectures. Systemic approach to infectious diseases and their agents. Each topic lectured by microbiologist (infectious agens), pathologist (pathological changes during infection), clinician (clinical symptoms, diagnostics and therapy). The aim of this block is to summarize acquired knowledge on microbiology and immunulogy as well as to covert thinking of future physicians to respect diagnostical consequences and make differential diagnostics for benefit of patient. To show evidence of close cooperation of different medical specialists for patient´s diagnosis and treatment, and the role of paraclinical subjects in this cooperation.

B01148 Mikrobiologie

(Adámková V., Doubková Z., Chanová M., Julák J., Kolářová L., Novák J., Pavlík E., Petříčková K., Prokešová L., ve spolupráci s VÚS: Broukal Z.

Určen pro studenty oboru zubního lékařství.

Poskytuje základní informace z obecné mikrobiologie, speciální lékařské mikrobiologie, virologie, mykologie a parazitologie. Seznamuje s nejdůležitějšími lidskými patogeny, s jejich vlastnostmi, se základy patogeneze příslušných onemocnění, se základy jejich diagnostiky, imunizace, antibiotické, antivirové, antifungální a antiparazitární terapie. Ve výuce jsou zdůrazněny aspekty mikroflóry dutiny ústní a přilehlých oblastí, jejich význam pro stomatologickou praxi a rizika infekcí vyvolaných touto mikroflórou při stomatologických zákrocích. Formou praktické výuky poskytuje základní dovednosti bakteriologického vyšetření vybraných klinických materiálů, seznamuje s metodami odběru vybraných klinických materiálů, se strategií identifikace bakterií a strategií antibiotické terapie. Seznamuje se zásadami požadavků na bakteriologické vyšetření a se základy interpretace jeho výsledků.

B81148 Microbiology

(Bobek J., Holada K., Chanová M., Pavlík E., Prokešová L. - ve spolupráci s VÚS: Broukal Z.) Určen pro studenty oboru zubního lékařství v anglickém jazyce.

Course provides basic knowledge of general and medical microbiology, special dental part of microbiology, virology, mycology and parasitology, the most important human patogens, their properties, diagnostics, immunization, antibiotics, antibacterial, virostatic, antipuncal and antiparasitic therapy, vaccination.

Microbiological apects of oral microbiome, special dental microbiological profile. Methods of treatment.

Practice: Techniques of sample collection of biological materials, methods of identification, stategy of antibacterial therapy - antibiotic centre, antibiotic policy, interpretation of results of laboratory investigation.

B02721 Speciální mikrobiologie a imunologie pro nutricionisty, potravinové alergie – prezenční forma

B02762 Speciální mikrobiologie a imunologie pro nutricionisty, potravinové alergie – kombinovaná forma

(Holada K., Mělková Z., Chanová M., Bobek J, Nováková M., Čechová D., Hrdý J., Petanová J., Posová H.) Určen pro studenty navazujícího magisterského oboru Nutriční specialista

Témata: Základy mikrobiologie, správné nutriční postupy z pohledu mikrobiologie. Běžné alimentární infekce bakteriální, virové, mykologické a parazitární, jejich prevence, diagnostika a léčba. Sterilizace, desinfekce, asepse, hygiena. Sezónnost výskytu alimentárních infekcí, možné zdroje infekcí a mikrobiálních kontaminací z pohledu behaviorálního, geografického a ontogenetického. Klinická imunologie a alergologie, imunopatologické stavy. Specializované nutriční postupy při potravinových alergiích (etiologie, klinický obraz, diagnostika, léčebné možnosti. Rozdělení dle příznaků - kožní reakce, reakce dýchacích cest, reakce zažívacího traktu. Alergie na mléko, na vejce, na mořské ryby, korýše a mušle, ovoce a zeleninu, na ořechy.

Přecitlivělost na určitý druh obilniny - přechodná). Nutriční postupy u imunosuprimovaných pacientů.

B01754 Mikrobiologie a imunologie – prezenční forma

(Bobek J., Matějů J., Doubková Z., Holada K., Chanová M., Pavlík E., Petanová J., Čechová D., Hrdý J.) B01841 Mikrobiologie a imunologie – kombinovaná forma

(Potužníková B., Chanová M., Hrdý J.)

B01718 +B01754 Mikrobiologie a imunologie

(Bobek J., Čechová D., Doubková Z., Holada K., Chanová M., Julák J., Pavlík E., Petanová J., Hrdý J.) Určen pro studenty bakalářských oborů Nutriční terapie a Všeobecná sestra.

Základní tématické okruhy: a) Obsah a zařazení předmětu lékařská mikrobiologie a imunologie. Základní vlastnosti nejvýznamnějších původců bakteriálních, virových, mykotických a parazitárních infekcí, formy přenosu infekčních agens. Komunitní, nosokomiální a oportunní infekce. Antibiotika. b) Antiinfekční imu- nita: Základní imunitní mechanismy a obrana proti infekcím: přirozená odolnost, navození imunitní odpově- di, buňkami zprostředkovaná imunita, protilátky, slizniční imunita, zánět. Dysfunkce imunitního systému a jejich ovlivnění: imunopatologické reakce a stavy (imunodeficience, autoimunita, alergie), imunomodulace.

c) Základy bakteriologie: Nejvýznamnější původci bakteriálních komunitních a nemocničních onemocnění, jejich základní vlastnosti a klasifikace bakterií. Nástroje virulence bakterií, patogeneze bakteriálních nákaz.

Význam a prevalence patogenních bakterií podle infekčních onemocnění. Formy šíření bakteriálních infekcí, prevence a profylaxe. Výběr postupu k identifikaci bakterií, klasické a speciální metody průkazu bakterií.

Přirozená citlivost a stav rezistence na antibiotika v ČR, antibiotika volby pro léčbu infekcí způsobených daným bakteriálním druhem. d) Význam správného vzorku pro diagnózu infekčního onemocnění. Charak- teristika validního vzorku a nezbytných údajů. Formy odběru, transportu a uchovávání biologických vzorků k mikrobiálnímu vyšetření. Zpracování vzorků. Kritéria odmítnutí vzorku k vyšetření. e) Základy virologie:

Nejvýznamnější původci virových komunitních a nemocničních onemocnění. Základní vlastnosti a klasifi- kace virů. Replikace virů, vztah virus - buňka. Formy šíření virových infekcí, prevence a profylaxe. Patoge- neze virových nákaz - lokalizované, diseminované, akutní, chronické a rekurentní infekce, pomalé virové infekce. f) Základy mykologie: Nejvýznamnější původci mykotických infekcí. Základní vlastnosti a klasifikace hub a kvasinek. Formy šíření mykotických infekcí, prevence a profylaxe. Patogeneze mykotických nákaz. Metody průkazu hub a kvasinek. Terapie mykotických infekcí. g) Základy parazitologie:

Nejvýznamnější původci parazitárních infekcí. Základní vlastnosti a klasifikace parazitárních agens. Formy šíření parazitárních infekcí, prevence a profylaxe. Patogeneze parazitárních nákaz. Metody přímého a nepřímého průkazu parazitů. Terapie parazitárních onemocnění.

B01670 Moderní diagnostické techniky v mikrobiologii a imunologii (Pavlík E.)

Určen pro studenty oborů všeobecného a zubního lékařství (3., 4., 5., 6. roč.)

Hlubší seznámení studentů s moderními technikami využitelnými v rutinní mikrobiologické a imunologické diagnostice, a to nejen v úrovni teoretické, nýbrž i formou praktického provedení vybraných technik.

Předmět je doplněn exkurzí do diagnostické laboratoře.

B81670 Modern Diagnostic Techniques in Medical Microbiology and Immunology (Pavlík E.)

Určen pro studenty oborů všeobecného a zubního lékařství (3., 4., 5., 6. roč.) v anglickém jazyce.

The subject serves to make students familiar with modern techniques implemented in routine diagnostics in microbiology and immunology not only in theory, but in hands-on practice with selected techniques.

Excurssion in a routine diagnostic laboratory is added.

B02086 Klinická mikrobiologie - diagnostika a interpretace laboratorních nálezů (Adámková V.)

Určen pro studenty oboru všeobecného lékařství (5. roč.)

Praktická účast studentů na diagnostickém procesu v laboratoři s následnou interpretací nálezů. Zpracování návrhů atb terapie a profylaxe. Účast na klinických vizitách na jednotkách intenzivní péče v rámci hemato- onkologie, chirurgie a ARO. Zpracování kasuistiky a její prezentace formou semináře na ÚIM.

B02087 Klinická mikrobiologie v oblasti primární péče (Adámková V.)

Určen pro studenty oboru všeobecného lékařství (5. roč.)

Diferenciální diagnostika infekcí v primární péči. Rozbor klinických případů interaktivní formou. Strategie ATB léčby v komunitě. Národní doporučené postupy a směrnice pro praktické lékaře.

B02088 Klinická mikrobiologie u hospitalizovaných pacientů (Adámková V., Kolářová L.)

Určen pro studenty oboru všeobecného lékařství (5. roč.)

Předmět se zabývá interdisciplinárním přístupem při řešení onemocnění infekčního původu, která jsou zejména spojena poskytovanou zdravotní péčí. Interaktivní formou jsou prakticky prezentovány diferen- ciálně diagnostické přístupy umožňující specifický průkaz agens, následnou terapii a prevenci šíření infekcí.

Důraz je kladen zejména na infekce urogenitální, krevního řečiště, respiračního traktu, v místě chirurgického výkonu apod. Součástí interaktivní výuky je osvětlení principů strategie používání antibiotik a základů surveillance infekcí.

B00134 Tropické nemoci 1, 2 (Stejskal F.)

Určen pro studenty oborů všeobecného a zubního lékařství (4., 5., 6. roč.)

Epidemiologie, diagnostika, klinika a terapie vybraných tropických infekčních onemocnění. Diferenciální diagnostika horečky a průjmů v tropech. HIV, AIDS v tropech. Oportunní tropické infekce. Tuberkulóza a lepra.

B80034 Tropical Diseases 1,2 (Stejskal F.)

Určen pro studenty oborů všeobecného a zubního lékařství (4., 5., 6. roč.)

B00055 Lékařská parazitologie (Nohýnková E., Chanová M.)

Určen pro studenty oborů všeobecného a zubního lékařství (2., 3., 4. roč.)

Předmět detailně seznamuje s původci parazitárních onemocnění, s jejich biologickými vlastnostmi ve vztahu k patogenezi onemocnění, se základy epidemiologie a klinického obrazu nákaz, s možnostmi a metodami diagnostiky původců a s kontrolou a základy léčby jednotlivých parazitóz. Zabývá se jak původci autochtonních, tak importovaných nákaz a jeho cílem je propojení znalostí studentů získaných v předchozím studiu s novými poznatky. Předmět je zakončen zápočtem ve formě písemného testu.

4.5. Výuka na jiných ústavech 1.LF UK, jiných fakultách UK a ostatních univerzitách a VŠ v ČR

4.5.1. Výuka na jiných ústavech a klinikách 1.LF UK

Fiziologický ústav 1.LF UK

- Fyziologie B00030 – Imunologické obranné reakce organizmu - Prokešová L. (1 přednáška) 1. chirurgická klinika – chirurgická propedeutika, 1.LF UK

- Imunologie v chirurgii – Petanová J. (1 přednáška) Ústav vědeckých informací 1.LF UK

- Organismus, mikrobiální agens a prostředí – Kolářová L., Adámková V. (1 přednáška) U3V - Obrana organismu a její mechanismy – Prokešová L., Posová H. (1 přednáška) U3V - Bílé krvinky a lymfatický systém. Čechová D. (1 přednáška) U3V

4.5.2. Výuka na jiných fakultách UK

2. LF UK (pro III. roč. všeobecného lékařství)

- Parazitologie I. Původci protozoárních onemocnění - Kolářová L., (1 přednáška), Ústav lékařské mikrobiologie

- Parazitologie II. Původci helmintárních onemocnění - Kolářová L., (1 přednáška), Ústav lékařské mikrobiologie

3. LF UK

Aktuální biologická témata v medicíně: Viry a priony jako nebuněčné patogeny - Priony a prionové choroby – Holada K. (přednáška), Oddělení buněčné a molekulární biologie, 3. LF UK

Medicína jako věda - 5.11.2017, Praha – přednáška „ Mikrobiom, slizniční imunita a chronická onemocnění“ - Tlaskalová H.

Organizace a přednáška v Kursu buněčné a molekulární základy imunologie, který byl určen pro účastníky doktorandského studia Biomedicíny UK (všech oborů) a další zájemce (7.2, 7.3., 4.4., 2.5., 13.6.2017) – Tlaskalová H.

PřF UK

- Klinická imunologie (MB150P41) – Tlaskalová H. (2 přednášky)

- Virus vakcínie a interakce s hostitelem – Mělková Z. (1 přednáška), Oddělení buněčné a molekulární biologie

- Od genomu k aktivním látkám -Petříčková K. (1 přednáška), Katedra genetiky a mikrobiologie

- Lékařská mikrobiologie MB140P70 – Julák J. (praktika, zkouška), Katedra genetiky a mikrobiologie

- Diagnostika a terapie parazitárních nákaz – Nohýnková E. (garant), Chanová M., Stejskal F. (LS, týdenní praktika a přednášky, zápočet + zkouška), Katedra parazitologie

Pedagogická fakulta UK

Univerzita třetího věku - Holada K: „Priony a neurodegenerace“, přednáška

4.5.3. Výuka na ostatních univerzitách a VŠ v ČR

Univerzita Jana Evangelisty Purkyně, Ústí nad Labem, Přírodovědecká fakulta Katedra biologie - Genomika a proteomika (ZS) J. Bobek

Katedra chemie - Mikrobiologie (LS) J. Bobek Univerzita Pardubice

- Expandující svět prionových chorob Holada K. (přednáška), Fakulta chemicko-technologická, Katedra biologických a biochemických věd

AV ČR

Holada K.: Pokroky v molekulární biologii a genetice, „Prions“, ÚMG AV ČR Praha, přednáška ČVUT

Některá pracoviště ústavu se podílejí na výuce studentů bakalářského studia Fakulty biomedicínského inženýrství Českého vysokého učení technického v Praze se sídlem v Kladně.

Katedra zdravotnických oborů a ochrany obyvatelstva – obor zdravotní laborant: předměty Obecná mikrobiologie (LS), Klinická mikrobiologie (ZS) Bobek J., Chanová M., Pavlík E., Správná laboratorní praxe (LS) Pavlík E., Klinická imunologie (ZS) Hrdý J. Základy Hygieny a epidemiologie (LS) Pavlík E.

Obor Krizové řízení a ochrana obyvatelstva Hygiena a epidemiologie (LS) Pavlík E.

Jihočeská univerzita, Přírodovědecká fakulta, České Budějovice Petříčková K. – Bakteriální genetika (ZS)

4.6. Specializační a celoživotní vzdělávání

Mimo výuku pregraduální a postgraduální v rámci 1. LF UK se ústav podílí i na předatestační výuce lékařů a dalších vysokoškolsky vzdělaných pracovníků zařazených do oborů Lékařská mikrobiologie, Mikrobiologie, Alergologie a klinická imunologie formou pořádání specializačních kurzů; ústav rovněž pořádá kurzy celoživotního vzdělávání, přičemž spolupracuje s IPVZ a ČLK.

Kurzy pořádané 1. LF UK Specializační:

Kolářová L.: Lékařská parazitologie, 3.10.–5.10.2017 Kolářová L.: Lékařská virologie, 6.11.–8.11.2017 Kontinuální:

Kolářová L.: Rezistence bakterií k antibiotikům 19.10. – 20.10. 2017

Přednášky v rámci kurzů pro IPVZ (pro lékaře a VŠ nelékaře v předatestační přípravě) Adámková V.: Klinická mikrobiologie – novinky, 6.3. – 10.3.2017

Holada K.: Metodický kurz v laboratorní imunologii – Priony a prionózy, 16. 11. 2017 Kolářová L.: Lékařská mykologie – novinky, 27.3. – 29.3. 2017

Kolářová L.: Lékařská bakteriologie - novinky, 3.4.– 7.4. 2017

Chanová M., Bernardová N., Tůmová P., Lecová L.: Mikroskopická diagnostika vybraných tkáňových helmintóz. Kurz lékařská parazitologie, 3.10.-5.10.2017

Pavlík E.: společný kmen laboratorních oborů 2x až 3x ročně Virologie 1, Zásady pro odběr a zpracování vzorků v mikrobiologické laboratoři, Biologické zbraně, bioterorismus a ochrana proti nim

Petanová J.: Imunitní tolerance a mechanismy vzniku autoimunitních chorob - předatestační kurz Alergologie a klinická imunologie Část 1, 4.5.2017

Posová H.: Když nemáme imunitu pod kontrolou – autoimunitní onemocnění. Kurz „Repetitorium alergologie a klinické imunologie“ Praha, IPVZ, 24.11.2017

Posová H.: Autoprotilátky v ambulanci klinického imunologa. Kurz „Metodický kurz v laboratorní imunologii“ Praha, IPVZ, 15.11.2017

4.7. Pregraduální studium – diplomanti, bakaláři

V laboratořích ÚIM a v laboratoři KIA ÚKBLD pracuje pod vedením učitelů řada studentů lékařských fakult a přírodovědecké fakulty UK a také studenti VŠCHT a ČVUT. Studenti mají možnost vypracovávat pod vedením zkušených pedagogů diplomové a bakalářské práce, nebo si jen vyzkoušet práci v laboratoři a prezentovat své výsledky např. v rámci Studentské vědecké konference.

Bobek J. Barbora Burýšková, studentka PřF UK, studentská vědecká činnost Matouš Čihák, student VŠCHT, studentská vědecká činnost Pavel Pohl, student UJEP, studentská vědecká činnost Inesa Music, studentka UJEP, studentská vědecká činnost

Holada K. Bc. Andrea Hujacová, studentka VŠCHT Praha, diplomová práce Hrdý J. Bc. Miroslava Gorelová, studentka PřF UK v Praze, diplomová práce

Bc. Lenka Súkeníková, studentka PřF UK v Praze, diplomová práce Bc. Kateřina Vlasáková, studentka PřF UK v Praze, diplomová práce Bc. Kateřina Macholdová, studentka PřF UK v Praze, diplomová práce Bc. Marek Jedlička, student PřF UK v Praze, diplomová práce

Bc. Šárka Hnilicová, studentka PřF UK v Praze, diplomová práce Flaviancia Mouyabi, studentka PřF UK v Praze, bakalářská práce Romana Kubrová, studentka PřF UK v Praze, bakalářská práce Adéla Navrátilová, studentka PřF UK v Praze, bakalářská práce Kateřina Lišková, studentka PřF UK v Praze, bakalářská práce Markéta Andrsová, studentka PřF UK v Praze, bakalářská práce Leona Ondřejíková, studentka ČVUT, bakalářská práce

Michaela Šímová, studentka ČVUT, bakalářská práce Nela Bukáčková, studentka ČVUT, bakalářská práce Chanová M. Bc. Nicol Bernardová, diplomová práce na PřF UK

Bc. Veronika Pavlíková, diplomová práce na PřF UK

Julák J. Ing. Pavel Hozák, PG student, Ústav počítačové a řídící techniky, Fakulta chemicko-inženýrská, VŠCHT Praha

Michaela Švarcová, diplomová práce na Ústavu mikrobiologie, Fakulta chemicko-inženýrská, VŠCHT Praha

Klára Lukášová, bakalářská práce, Ústav fyziky a měřicí techniky, Fakulta chemicko-inženýrská, VŠCHT Praha

Ondřej Bláha, bakalářská práce, Ústav fyziky a měřicí techniky, Fakulta chemicko-inženýrská, VŠCHT Praha

Michael Puffer, bakalářská práce, Ústav fyziky a měřicí techniky, Fakulta chemicko-inženýrská, VŠCHT Praha

Kujalová Lucie, PG student, Ústav fyziky a měřicí techniky, Fakulta chemicko-inženýrská, VŠCHT Praha

Mělková Z. Bc. Hana Pilná, studentka PřF UK v Praze, diplomová práce Nohýnková E. Bc. Ivana Markovičová, studentka PřF UK, diplomová práce

Petříčková K. Zuzana Žlábková, studentka Zdravotně sociální fakulty Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích, bakalářská práce

Bc. Andrej Herbrík, student PřF UK v Praze, diplomová práce Bc. Barbora Jílková, student PřF UK v Praze, diplomová práce Bc. Petra Rašmanová, student PřF UK v Praze, diplomová práce

Bc. Petr Pospíchal, student PřF Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích, diplomová práce

4.7.1. Obhájené bakalářské práce

Flaviancia Mouyabi (školitel Hrdý J.): Úloha přirozených lymfoidních buněk při infekci virem chřipky, 15.9. 2017

Romana Kubrová (školitel Hrdý J.): T regulační buňky v pupečníkové krvi dětí zdravých a alergických matek, 15.9. 2017

Adéla Navrátilová (školitel Hrdý J.): Role myeloidních dendritických buněk při patogenezi alergických onemocnění, 5.6. 2017

Leona Ondřejíková (školitel Hrdý J.): Rozdílné vlastnosti T regulačních buněk v pupečníkové krvi novorozenců zdravých a alergických matek, 20.6. 2017

Ivana Markovičová (školitelka Nohýnková E.): Volně žijící améby jako původci nákaz člověka, září 2017

4.7.2. Obhájené diplomové práce

Matouš Čihák (školitel-konzultant Jan Bobek): Ověření produkce sekundárních metabolitů v průběhu germinace Streptomyces coelicolor, červen 2017

Súkeníková L. (školitel Hrdý J.): Rozdílná schopnost in vitro vypěstovaných dendritických buněk dětí zdravých a alergických matek stimulovat imunitní odpověď, 11.9. 2017

Vlasáková K. (školitel Hrdý J.): Odlišné vlastnosti buněk pupečníkové krve novorozenců zdravých a alergických matek, 11.9. 2017

4.8. Postgraduální studium

Na našem ústavu pracovalo 12 studentů v rámci doktorského studia z různých biomedicínských oborů (Fyziologie a patofyziologie člověka, Imunologie, Molekulární a buněčná biologie, genetika a virologie,

mikrobiologie, biochemie a patobiochemie). Studenti se zúčastňují SVK, jsou spolu se svými školiteli řešiteli grantů GA UK a také se různou formou podílejí na výuce ústavu.

4.8.1. Školitelé v postgraduálním studiu

Seznam studentů podle svých školitelů spolu s biomedicínským oborem, v němž jsou zařazeni:

Bobek J. školitel v oboru: Mikrobiologie Ing. Klára Šmídová

Ing. Dita Šetinová

Holada K. školitel v oboru: Molekulární a buněčná biologie, genetika a virologie 1. LF UK Mgr. Marcela Filipová

Mgr. Zdeňka Hanusová Mgr. Zuzana Fremuntová

Mgr. Marie Kostelanská Mgr. Jakub Soukup

Mgr. Kristýna Vrbová Hrdý J. školitel v oboru: Imunologie

MUDr. Mgr. Viktor Černý Mgr. Lenka Súkeníková

Hrušková Z. školitelka v oboru: Fyziologie a patofyziologie člověka MUDr. Zdeňka Chocová

MUDr. Doubravka Frausová

Kolářová L. školitel specialista v oboru: Biochemie a patobiochemie člověka RNDr. Jan Novák

Mělková Z. školitelka v oboru: Molekulární a buněčná biologie, genetika a virologie, 1. LF UK Ing. Michaela Madleňáková

Nohýnková E. školitelka v oboru: Parazitologie, 1.LF a PřF UK RNDr. Eva Bínová (rodičovská dovolená) RNDr. Kristýna Marková

Mgr. Magdalena Uzlíková (mateřská dovolená) Pavlík E. školitel specialista v oboru: Experimentální chirurgie MUDr. Eva Nártová

školitel v oboru: Ochrana obyvatelstva FBMI ČVUT MUDr. Barbora Drnková

MUDr. Daniela Obitková Ing. Milan Mráz

Posová H. školitelka v oboru: Fyziologie a patofyziologie člověka MUDr. Michaela Šafářová (mateřská dovolená) MUDr. Lucia Skáčiková

RNDr. Romana Veselá (mateřská dovolená) školitelka v oboru: Imunologie

Ing. Miroslav Hinďoš 4.8.2. Obhájené dizertační práce

NÁRTOVÁ EVA MUDr. (školitel specialista Pavlík E.): Detekce a genotypizace kmenů Helicobacter pylori ve Waldeyerově lymfatickém okruhu a jeho vztah ke vzniku patologií v této oblasti

4.8.3. Předatestační příprava

Pracovníci ÚIM se podíleli na specializační průpravě klinických imunologů a alergologů, infektologů (odborné stáže v ambulancích, přednášky), laboratorních imunologů (zkušební komise), lékařů mikrobiologů (praxe v mikrobiologické laboratoři, zkušební komise). Rovněž pořádali specializační kurzy (viz. 6.1).

Lékařská mikrobiologie (Kolářová L., Adámková V.) 4.8.4. Zkušební a hodnotící komise

- Akreditační komise MZČR pro Alergologii a klinickou imunologii (Posová H.)

- Akreditační komise MZČR pro Lékařskou mikrobiologii (Pavlík E. předseda) – do 1.7.2017 - Akreditační komise MZČR pro Lékařskou mikrobiologii (Kolářová L., předsedkyně) - Komise IGA MZ ČR (Kolářová L.).

- Komise pro obhajobu habilitační práce 1. LF UK (Kolářová L. - předsedkyně).

- Komise pro obhajoby a státní zkoušky, Přírodovědecká fakulta UK (Julák J.) - Komise pro státní zkoušky pro obor Mikrobiologie (NMIKRO), PřF UK (Julák J.)

- Komise pro státní závěrečné zkoušky navazujícího magisterského studia programu Biologie obor Parazitologie (MSZBN021) PřF UK (Nohýnková E.)

- Komise pro státní rigorózní zkoušky obor Parazitologie, PřF UK (Nohýnková E.) - Komise pro státní doktorské zkoušky v programu Parazitologie, PřF UK (Nohýnková E.)

- Komise pro státní závěrečné zkoušky v navazujícím magisterském studiu biologie, PřF UJEP (Bobek J.) - Komise pro státní závěrečné zkoušky pro obor zdravotní laborant FBMI ČVUT (Pavlík E.)

- Komise pro státní závěrečné zkoušky pro obor krizoví řízení a OO FBMI ČVUT (Pavlík E.).

- Komise pro státní závěrečné zkoušky v navazujícím magisterském studiu Ochrana obyvatelstva FBMI ČVUT (Pavlík E.)

- Komise Studentské vědecké konference VŠCHT v Praze, sekce Fyzika (Julák J.).

- Oborová rada doktorského studijního programu v biomedicíně UK:

Parazitologie (Kolářová L.);

Imunologie (Posová H.).

Mikrobiologie (Julák J.)

- Oborová rada doktorského studijního programu Parazitologie na 1. LF a PřF UK (Nohýnková E., Stejskal F.)

- Oborová rada doktorského studia „Infekční biologie“ na Přírodovědecké fakultě Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích (Prokešová L.)

- Oborová rada doktorského studijního programu Mikrobiologie LF HK (Kolářová L.) - Oborová rada Mikrobiologie, Přírodovědecká fakulta UK (Julák J.)

- Oborová rada parazitologie UK

- Zkušební komise IPVZ – MZČR pro získání specializované způsobilosti v oborech:

Lékařská mikrobiologie (Kolářová L., Adámková V.);

Mikrobiologie (Kolářová L., Adámková V.);

Lékařská imunologie (Posová H.).

- Zkušební komise MZ ČR akreditovaného kvalifikačního kurzu Odborné zdravotnické laboratorní metody (Posová H., Kolářová L., Stříž I.).

4.9. Semináře ÚIM

Společné vědecko-výzkumné semináře Ústavu imunologie a mikrobiologie a III. kliniky infekčních a tropických nemocí 1. LF UK v roce 2017:

11. - 13. 10. 2017, výjezdní zasedání programu SVV Patejdlova bouda, Špindlerův Mlýn:

Bačkovská Hanusová Z.: Characterization of the conformation-dependent anti-prion antibody EM-20 Čihák M.: Secondary metabolites produced during the germination of Streptomyces coelicolor

Kostelanská M.: The Way to Inactivate Prions with a Pinch of Phthalocyanine in a Red Light District of Two Different Light Devices

Madleňáková M.: Heme-arginate as a latency reversing agent for HIV-1 cure Marková K.: Notes on mitotic control in Giardia intestinalis

5. VĚDECKO-VÝZKUMNÁ ČINNOST

Vědecká činnost ústavu se opírala o studium otázek z mikrobiologické a imunologické oblasti. Výzkum v oblasti mikrobiologie zaměřen na studium biologie mikroorganismů se zvláštním zřetelem na jejich patogenitu, imunitní odpověď hostitelského organismu, produkci antibiotik, rozvoj moderních me-tod umožňujících detekci a identifikaci infekčních agens i na molekulární úrovni s praktickým dopadem na laboratorní diagnostiku, nových metod dezinfekce a sterilizace a v neposlední řadě i na možnosti terapie in- fekčních onemocnění. Ze specifických výzkumných problematik lze např. jmenovat studium vlastností Heli- cobacter pylori, chemických a biologických vlastností bakteriálních imunomodulátorů založených na bakte- riích Propionibacterium acnes a Bacillus firmus a jejich frakcí s praktickým dopadem na vývoj, výrobu a kli- nické aplikace registrovaného léčiva imunomodulační vakcíny Corynebacterium parvum, instrumentálních metod chemické analýzy v mikrobiální taxonomii. Studium regulací buněčných pochodů v průběhu diferen- ciace a produkce antibiotik u bakterií Streptomyces spp. zejména na úrovni regulačních RNA.

Virologický výzkum je dlouhodobě zaměřen na studium interakcí viru vakcínie a HIV-1 s hostitelskou buňkou a organismem. V posledních letech to je zejména studium charakteru buněčné smrti buněk infikovaných virem vakcínie a jeho významu pro imunitní odpověď, vývoj myšího modelu eczema vaccinatum a studium jeho patogeneze, a studium vlivu redox modulujících látek na růst a replikaci viru vakcínie a HIV-1. Prionová laboratoř ústavu se věnuje studiu patogeneze prionových chorob a fyziologické úlohy buněčného prionového proteinu. V návaznosti na studium toxicity amyloidových proteinových agregátů je ve spolupráci studována problematika toxicity nanomateriálů. Aplikovaný výzkum prionové laboratoře je zaměřen na vývoj nových laboratorních metod pro diagnostiku neurodegenerativních onemocnění, včetně roztroušené sklerózy a vývoj nových metod inaktivace prionů.

V neposlední řadě se ke specifickým výzkumným cílům nově řadí i studie v oblasti biologie helmintárních agens, vedoucí např. k charakterizaci biologických vlastností parazitů a jejich migračních drah v hos- titelském organismu. V současné době se ústav zaměřuje i na řešení otázek z oblasti antibiotické rezistence a hledání nových bioaktivních látek. Ve spolupráci s VŠCHT a ČVUT probíhá výzkum dezinfekčního a sterili- začního působení nízkoteplotního plazmatu generovaného elektrickými výboji na různé mikroorganismy.

Ve spolupráci s Ústavem epidemiologie a ochrany veřejného zdraví Lékařské fakulty Ostravské univerzity, s Podiatrickým centrem Medicia Ostrava a s Dermatovenerologickou klinikou 1. LF UK a VFN v Praze probíhá klinická studie terapie onychomykózy nízkoteplotním plazmatem.

V oblasti imunologie jsou výzkumné cíle zaměřeny na studium vlivu infekčních agens v patogenezi alergií a autoimunit. Ze specifických cílů lze jmenovat např. sledování vlivu farmak na imunologické parametry a možností ovlivnění imunitního systému bakteriemi a jejich složkami. Aplikovaný výzkum vychází z klinické základny ústavu a zaměřuje se na studium vlivu střevní mikroflóry a kolostra na imunitní systém dětí alergických matek a na prevenci alergických chorob molekulárně biologické charakterizace buněk u vybraných autoimunit, klinicky závažných stavů, možností diagnostické prevence (autoprotilátky). Výzkum probíhá v úzké spolupráci s dalšími lékařskými obory (řešení problematiky recidivujících infekcí u pacientů s roztroušenou sklerózou, sledování změn imunitních funkcí vyvolaných vlivy prostředí, problematika slizniční imunity ve stomatologii).

Nově se zformovala skupina zaměřená na studium vláknitých diferencujících bakterií streptomycet, významného zdroje biologicky aktivních látek s farmaceutickým využitím. Kromě studia regulačních principů (malé regulační RNA) v metabolismu a diferenciaci těchto bakterií, se ve spolupráci s oddělením imunologie, PřF JU a IKEM věnuje produkci sekundárních metabolitů s protizánětlivými a imunomodulačními účinky a testování jejich účinků na buňky lidského imunitního systému. Ve spolupráci s Ústavem půdní biologie Biologického centra AV ČR v Českých Budějovicích, NRL pro patogenní aktinomycety v Trutnově, Oblastní nemocnicí v Příbrami a Zdravotním ústavem se sídlem v Ostravě pracuje na vytvoření sbírky streptomycet izolovaných z lidských vzorků. Cílem práce je charakterizovat specifické

ekologické adaptace těchto izolátů, zhodnotit jejich klinický význam zejména v rozvoji chronických zánětlivých onemocnění dolních cest dýchacích a ověřit jejich potenciál v oblasti produkce nových imunomodulačních látek, příp. antibiotik.

5.1. Granty

5.1.1. Grantové projekty

AZV 15-26877A (Hrdý J. – řešitel), 2015 – 2018

Vliv časného postnatálního osídlení novorozenců E. coli na výskyt alergie, vybraných imunologických charakteristik a složení střevní mikrobioty.

členky týmu: Prokešová L., Novotná O., Petrásková P.

AZV MZ ČR 15-33369A (Nohýnková E. – hlavní řešitel), 2015 – 2018 AZV MZ ČR 15–29336A (Petanová J. – hlavní řešitel), 2015 – 2018

Změny imunologické reaktivity u pacientů s recidivujícími aftami.

GA ČR 16-15020S (Holada K. – vedoucí laboratoře, hl. řeš. PřF UK), 2016-2020

členové týmu: Holada K., Hanusová z., Hujacová A., Tahtahová B., Pšeničková A.

GA UK 290215 (Šetinová D. – hlavní řešitel), 2015 – 2017

Identifikace regulačních RNA kontrolujících produkci antibiotik u rodu Streptomyces.

garant: Bobek J.

GA UK 32915 (Novák J. – hlavní řešitel), 2015 – 2017

Imunitní odpověď myší při infekcích CNS larvami Toxocara canis.

garant: Horák P.

GA UK 140215 (Kostelanská M. – hlavní řešitel), 2015 – 2017 Fotodynamická inaktivace prionů.

garant: Holada K.

GA UK 530217 (Fremuntová Z. – hlavní řešitel) 2017-2019

Studium funkce buněčného prionového proteinu (PrPC) v 3D in vitro modelu s využitím systému CRISPR/Cas9

garant: Holada K.

GA UK 360216 (Soukup J. – hlavní řešitel) 2016-2018

Úloha extracelulárních váčků v přenosu prionové infekce garant: Holada K.

UNCE 204022 (spoluřešitel Holada K., hlavní řešitel – Raška I.), 2017 Struktura, organizace a dynamika chromatinu.

členové týmu: Holada K., Moško T., Šafaříková E.

UNCE 204017 (spoluřešitel Kolářová L., hlavní řešitel – Tachezy J.), 2017

Molekulární interakce mezi parazity a hostiteli a nové strategie boje proti parazitálním infekcím členové týmu: Kolářová L. Hrdý J., Chanová M.

SVV 260369 (Mělková Z. – řešitel), 2017-2019

Studium infekčních chorob a jejich příčinných agens.

členové týmu: Holada K., Kolářová L., Posová H., Julák J., Bobek J., Nohýnková E., Chanová M., Hrdý J.

AZV 15–32961A (Holada K. – hlavní řešitel), 2015 – 2019 Buněčné mikrovesikuly v diagnostice roztroušené sklerózy.

členové týmu: Holada K., Moško T., Pšeničková A., Tahtahová B., Soukup J., Kostelanská M., Jindrová Z.

AZV 17-31403A ( Moško T. – spoluřešitel, hl řeš. doc. MUDr. Zbyněk Straňák, CSc. – Ústav pro péči o matku a dítě), 2017- 2020

Diagnostický potenciál buněčných mikropartikulí v patogenezi systémové zánětlivé odpovědi plodu členové týmu: Hujacová A., Pšeničková A., Tahtahová B.

AZV 17-30091A (Petříček M. – spoluřešitel, hl. řešitel K. Petříčková – PřF JU v Českých Budějovicích) 2017-2020

Unikátní biosyntetické enzymy jako klíč k novým bioaktivním látkám členové týmu: Petříčková K., Hrdý J., Čihák M.

5.1.2. Výzkumné záměry – spolupráce

PROGRES Q25/LF1 (spoluřešitel Kolářová L., hlavní řešeitel – Škrha J.), 2017-2021

členové týmu: Kolářová L., Prokešová L., Novotná O., Čechová D., Petanová J., Petrásková P., Nováková M., Chanová M., Hrdý J., Posová H.

PROGRES Q26 (spoluřešitel Holada K., hlavní řešitel Vokurka M.), 2017 - 2021 Molekulová, buněčná a patofyziologická podstata nemocí.

členové týmu: Mělková Z., Bobek J., Hájková V., Kaplanová M., Hanusová Z., Pšeničková A., Tahtahová B., Šetinová D., Moško T., Kostelanská M., Soukup J., Madleňáková M. Nohýnková E., Tůmová P., Weisz F.

BIOCEV 0109 BCV (Mělková Z. – řešitel), 2017

Studium interakcí viru vakcinie s hostitelem a reaktivace latentního HIV -1.

členové týmu: Hájková V., Kaplanová M., Madleňáková M.

UNCE 204017 (spoluřešitel Kolářová L., hlavní řešitel – Tachezy J., PřFUK)

Molekulární interakce mezi parazity a hostiteli a nové strategie boje proti parazitálním infekcím Členové týmu: Posová H., Chanová M., Hrdý J., Hrušková Z.

6. PUBLIKAČNÍ ČINNOST

6.1. Přehled publikační činnosti v letech 2005 – 2016

2006 2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 2017 Články v časopise

s IF 25 36 33 28 28 24 13 16 19 16 13 20

Články v časopise

bez IF 31 18 17 11 13 10 6 16 9 13 9 4

Monografie jako

celek 2 1 0 2 0 0 0 2 2 1 0 0

Kapitoly

v monografiích 2 10 1 6 1 1 2 6 0 9 2 1

Učebnice jako

celek 1 1 1 1 1 0 0 0 0 1 0 0

Kapitoly v

učebnicích 0 1 0 1 0 4 1 0 0 0 0 1

Příručky, manuály, slovníky, encyklopedie,

překlady

1 1 2 1 0 3 1 1 0 0 1 0

Patenty a užitné

vzory 1 0 0 0 0 1 3 1 0 0 0 0

Citační ohlasy dle

WoS 478 182* 250* 228* 243* 362 329 440 464 449 620

*Přehled obsahuje pouze citační ohlasy prací dedikovaných 1. lékařské fakultě UK v Praze a publikace s uvedenou adresou Ústavu imunologie a mikrobiologie 1. LF UK a VFN

6.2. Původní odborné práce

ŠETINOVÁ D, ŠMÍDOVÁ K, POHL P, MUSIĆ I AND BOBEK J RNase III-binding-mRNAs revealed novel complementary transcripts in Streptomyces. Front Microbiol. 2018 Jan 15;8:2693. doi:

10.3389/fmicb.2017.02693. eCollection 2017.

ČIHÁK M, KAMENÍK Z, ŠMÍDOVÁ K, BERGMAN N, BENADA O, KOFROŇOVÁ O, PETŘÍČKOVÁ K AND BOBEK J (2017) Secondary Metabolites Produced during the Germination of Streptomyces coelicolor. Front Microbiol. 2017 Dec 13;8:2495. doi: 10.3389/fmicb.2017.02495. eCollection 2017.

článek ve sborníku: ČIHÁK M, POHL P, MUSIĆ I, KAMENÍK Z, BOBEK J, MASÁK J (2017) Ověření produkce sekundárních metabolitů v průběhu germinace Streptomyces coelicolor. Sborník konference KVASNÁ CHEMIE A BIOINŽENÝRSTVÍ, seminář - inovační výstupy využitelné v praxi 11.

dubna 2017 (ISBN: 978-80-7080-996-9)

HANUSOVÁ Z., MOŠKO T., MATEJ R., HOLADA K. Precision in the design of an experimental study deflects the significance of proteinase-activated receptor 2 expression in scrapie-inoculated mice. J Gen Virol. 2017 Jun;98(6):1563-1569. doi: 10.1099/jgv.0.000803. Epub 2017 Jun 14.

KOLÁŘOVÁ L., MATĚJŮ J., HOZÁKOVÁ L., STEJSKAL F., HRDÝ J., KOLÁŘOVÁ H., LEISSOVÁ M., SKÁLA V., DUNDR P.: Humánní alveolární echinokokóza a přehled výskytu tasemnic Echinococcus multilocularis u zvířat v České republice. Epidemiol Mikrobiol Imunol. 2017 Fall;66(4):163- 172. Czech.

SÚKENÍKOVÁ L., ČERNÝ V.,NOVOTNÁ O., PETRÁSKOVÁ P., BORÁKOVÁ K., KOLÁŘOVÁ L., PROKEŠOVÁ L., HRDÝ J.: Different capacity of in vitro generated myeloid dendritic cells of newborns of healthy and allergic mothers to respond to probiotic strain E. coli O83:K24:H31. Immunol Lett. 2017 Sep;189:82-89. doi: 10.1016/j.imlet.2017.05.013. Epub 2017 May 26.