POSUDEK OPONENTA ZÁVĚREČNÉ PRÁCE
I. IDENTIFIKAČNÍ ÚDAJE
Název práce:
Data Analysis of Laboratory Workflow and Data-driven Laboratory Process Optimization
Jméno autora:
Patrik Březina
Typ práce:
diplomová
Fakulta/ústav:
Fakulta elektrotechnická (FEL)
Katedra/ústav:Katedra počítačů
Oponent práce:
Ing. Petr Váňa
Pracoviště oponenta práce:Katedra počítačů
II. HODNOCENÍ JEDNOTLIVÝCH KRITÉRIÍ
Zadání náročnější
Hodnocení náročnosti zadání závěrečné práce.
Zadání považuji za náročnější, protože se student musel nejprve podrobně seznámit s problematikou testování organických vzorku v laboratoři Prevedig Medical. Laboratoř obsahuje několik komponent s rozdílnými vlastnostmi pro testování vzorků od pacientů. Je tudíž nutno pracovat s větším počtem podmínek, které je nutné zahrnout do navrhovaných optimalizačních přístupů.
Splnění zadání splněno
Posuďte, zda předložená závěrečná práce splňuje zadání. V komentáři případně uveďte body zadání, které nebyly zcela splněny, nebo zda je práce oproti zadání rozšířena. Nebylo-li zadání zcela splněno, pokuste se posoudit závažnost, dopady a případně i příčiny jednotlivých nedostatků.
Zadání práce považuji za splněné. Podařilo se identifikovat úzká místa a optimalizovat je pomocí navrhovaných metod.
Poskytnuté výsledky byly získány na základě reálných anonymizovaných dat.
Zvolený postup řešení správný
Posuďte, zda student zvolil správný postup nebo metody řešení.
Zvolený postup považuji za správný. Práce je rozdělena na dvě části. V prní části se řeší přiřazení jednotlivých zadaných testů k jednotlivým komponentám. Toto přiřazení zůstává stejné po celou dobu optimalizovaného úseku (několik dní). Tento problém je řešen pomocí dvou metod: ILP a evolučního algoritmu. V druhé části se naopak řeší naplánování jednotlivých testů do časových slotů tak, aby byla minimalizována doba zpracování. Tato část je řešena pouze pomocí ILP.
Odborná úroveň A - výborně
Posuďte úroveň odbornosti závěrečné práce, využití znalostí získaných studiem a z odborné literatury, využití podkladů a dat získaných z praxe.
Odborná úroveň této závěrečné práce je vysoká.
Formální a jazyková úroveň, rozsah práce B – velmi dobře Posuďte správnost používání formálních zápisů obsažených v práci. Posuďte typografickou a jazykovou stránku.
Jazyková úroveň je vysoká a rozsah práce naprosto dostatečný. Mám pouze několik připomínek k formální úrovni práce.
Použité rovnice bych doporučil očíslovat. Například v Sekci 4.2.3 očíslované jsou, ale v Sekci 5.2.3 již ne. Popis obou ILP formulací je občas trochu nepřehledný, což je dáno především velkým množstvím podmínek. Navíc nejsou rovnice popisující jednotlivé podmínky vždy zcela totožné v textu a v ILP formulaci. Jedná se pouze o drobné změny, ale přesto by bylo lepší provázat lépe text s finální ILP formulací. Též násobení není v práci značeno zcela konzistentně. Někdy je použita tečka, někdy hvězdička a někdy je symbol operace vynechán.
1/2
POSUDEK OPONENTA ZÁVĚREČNÉ PRÁCE
Výběr zdrojů, korektnost citací B – velmi dobře
Vyjádřete se k aktivitě studenta při získávání a využívání studijních materiálů k řešení závěrečné práce. Charakterizujte výběr pramenů. Posuďte, zda student využil všechny relevantní zdroje. Ověřte, zda jsou všechny převzaté prvky řádně odlišeny od vlastních výsledků a úvah, zda nedošlo k porušení citační etiky a zda jsou bibliografické citace úplné a v souladu s citačními zvyklostmi a normami.
Výběr zdrojů je v pořádku, pouze by jich mohlo být o trochu více. U online zdrojů by měl být uveden konkrétní datum navštívení.
Další komentáře a hodnocení
Vyjádřete se k úrovni dosažených hlavních výsledků závěrečné práce, např. k úrovni teoretických výsledků, nebo k úrovni a funkčnosti technického nebo programového vytvořeného řešení, publikačním výstupům, experimentální zručnosti apod.
Formulace optimalizačních úloh je silně zaměřena na konkrétní doménu a specifické vlastnosti a omezení jednotlivých přístrojů v laboratoři. Za vhodnější bych považoval obecnější formulaci, která by umožnila jednodušší nasazení v jakékoliv laboratoři.
III. CELKOVÉ HODNOCENÍ, OTÁZKY K OBHAJOBĚ, NÁVRH KLASIFIKACE
Shrňte aspekty závěrečné práce, které nejvíce ovlivnily Vaše celkové hodnocení. Uveďte případné otázky, které by měl student zodpovědět při obhajobě závěrečné práce před komisí.
Otázky oponenta:
1. Proč je počet transportů omezen pomocí konstanty? Nebylo by vhodnější tento počet zakomponovat do optimalizované účelové funkce?
2. Jsou získané znalosti a optimalizační modely použitelné i pro ostatní obdobné laboratoře?
Předloženou závěrečnou práci hodnotím klasifikačním stupněm A – výborně.
Datum: 17. 6. 2021 Podpis:
2/2
